Научный журнал ФГБУН ВолНЦ РАН
(сетевое издание)
RuEn

рубрика "Разведение, селекция и генетика сельскохозяйственных животных"

Скрининг гаплотипа фертильности АН1 айрширской породы крупного рогатого скота Центрального и Северо-Западного регионов России

Гладырь Е.А., Терновская О.А., Костюнина О.В.

Том 1, №4, 2018

Гладырь Е.А., Терновская О.А., Костюнина О.В. Скрининг гаплотипа фертильности АН1 айрширской породы крупного рогатого скота Центрального и Северо-Западного регионов России // Агро- ЗооТехника. 2018. Т. 1. № 4. DOI: 10.15838/alt.2018.1.4.1 URL: http://azt-journal.ru/article/28026 DOI: 10.15838/alt.2018.1.4.1

DOI: 10.15838/alt.2018.1.4.1

Аннотация   |   Авторы   |   Список литературы
  1. FABA. 2018. Available at: http://www.faba.fi/ru/dairy/breeding (accessed 30.09.2018).
  2. Тулинова О.В., Васильева Е.Н., Трошкин Е.А., Соловей Г.П., Соловей В.Б. Генетический потенциал айрширского скота племенного завода «Новоладожский» Ленинградской области // Молочное и мясное скотоводство. 2015. № 5. С. 22–25.
  3. Ежегодник по племенной работе в молочном скотоводстве в хозяйствах Российской Федерации (2017 год) / И.М. Дунин [и др.]. М.: Изд-во ФГБНУ ВНИИплем, 2018. 274 с.
  4. ВНИИПлем. База данных национального генофонда. База данных по национальному генофонду сельскохозяйственных животных – племенного КРС молочного направления продуктивности. 2018. URL: http://xn--b1agiaphcs.xn--p1ai/grpzh (дата обращения 30.09.2018).
  5. ВНИИПлем. База данных быков по породам. Айрширская порода. 2017. URL: http://xn--b1agiaphcs.xn--p1ai/rus/files/Database/Bulls/2017/ajrshirskaya-poroda-bb.pdf (дата обращения 30.09.2018).
  6. Тулинова О.В. Итоги и стратегия совершенствования популяций айрширской породы молочного скота Российской Федерации // Семинар «Современные приемы и методы селекции в племенном молочном скотоводстве». СПб., 2017. 37 с. URL: http://vniigen.ru/wp-content/uploads/2018/01/Итоги-и-стратегия-совершенствования-современной-популяции-айрширской-породы.pdf (дата обращения 30.09.2018).
  7. Сивкин Н.В., Чинаров А.В. Конкурентные преимущества отечественных пород крупного рогатого скота // Сб. науч. тр. по мат-лам Нац. науч.-практ. конф. к юбилею заслуж. работника сел. хоз-ва, д-ра с.-х. наук, проф. Р.В. Тамаровой, 12 октября 2017 г. «Современное состояние отечественных пород крупного рогатого скота и перспективы их качественного улучшения». Ярославль, 2017, с. 99–105.
  8. Чекменева Н.Ю. Повышение генетического потенциала продуктивности молочного скота айрширской породы: дис. ... д-ра с.-х. наук. СПб. – Пушкин, 2007. 274 c.
  9. Фураева Н.С. Повышение эффективности разведения молочных пород скота в Ярославской области: дис ... д-ра с.-х. наук. Ярославль, 2016. 397 c.
  10. ABA. Американская ассоциация заводчиков айрширского скота. Available at: http://www.usayrshire.com/genetics.html (accessed 01.10.2018).
  11. CSA. Общество разведения айрширского крупного рогатого скота Великобритании и Ирландии. Available at: https://www.ayrshirescs.org/ayrshires-cattle-society/animal-search (accessed 01.10.2018).
  12. Чекменева Н.Ю., Князева Т.А. Интродукция генофонда красных пород Скандинавии в генеалогическую структуру молочных пород России // Молочное и мясное скотоводство. 2015. № 5. С. 16–19.
  13. Чистякова И.А. Хозяйственно полезные признаки айршир-голштинских помесей разных генотипов: дис. ... канд. биол. наук. Петрозаводск, 2004. 177 c.
  14. Zhou L., Heringstad B., Guldbrandtsen G.Su., Meuwissen T.H.E., Svendsen M., Grove H., Nielsen U.S., Lund M.S. Genomic predictions based on a joint reference population for the Nordic Red cattle breeds. Journal of Dairy Science, 2014, vol. 97, no. 7, pp. 4485–4496. DOI:10.3168/jds.2013-7580
  15. Смирнова О.В., Тележенко Е.В. Современное состояние селекции красных североевропейских молочных пород группы Viking Red // Молочное и мясное скотоводство. 2015. № 5. С. 13–15.
  16. Olsen H.G., Hayes B.J., Kent M.P., Nome T., Svendsen M., Larsgard A.G., Lien S. Genome-wide association mapping in Norwegian Red cattle identifies quantitative trait loci for fertility and milk production on BTA12. Animal Genetics, 2011, vol. 42, рр. 466–474. DOI: 10.1111/j.1365-2052.2011.02179.x
  17. Bett R.C., Johansson K., Zonabend E., Malmfors B., Ojango J., Okeyo M., Philipsson J. Trajectories of evolution and extinction in the Swedish cattle breeds. In Proc. 9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. Leipzig, 2010.
  18. Jorjani H., Jakobsen J., Nilforooshan M.A., Hjerpe E., Zumbach B., Palucci V., Durr J. Genomic evaluation of BSW populations InterGenomics: Results and deliverables. Interbull Bulletin, 2011, vol. 43, рр. 5–8.
  19. Vanraden P.M., Olson K.M., Null D.J., Sargolzaei M., Winters M., van Kaam J.B.C.H.M. Reliability increases from combining 50,000- and 777,000-marker genotypes from four countries. Interbull Bulletin, 2012, vol. 46, рр. 75–79.
  20. Тележенко Е.В. Селекция на рентабильность, или какие коровы нам нужны. URL: fs-1.5mpublishing.com/.../Евгений-Тележенко_Селекция-на-рентабельность-или-какие-коровы-нам-нужны (дата обращения 30.09.2018).
  21. Голохвастова С.А., Егиазарян А.В. Генетика быков и сексированное семя // Сельскохозяйственные вести. 2014. № 4. С. 12–15.
  22. Heins B.J., Hansen L.B. Short communication: Fertility, somatic cell score, and production of Normande × Holstein, Montbéliarde × Holstein, and Scandinavian Red × Holstein crossbreds versus pure Holsteins during their first 5 lactations. Journal of Dairy Science, 2012, vol. 95, iss. 2, рр. 918–924. DOI: 10.3168/jds.2011-4525
  23. Cooper T.A., Wiggans G.R., VanRaden P.M., Hutchison J.L., Cole J.B., Null D.J. Genomic evaluation of Ayrshire dairy cattle and new haplotypes affecting fertility and stillbirth in Holstein, Brown Swiss and Ayrshire breeds. JAM, 2013, T206, р. 1.
  24. Venhoranta H., Pausch H., Flisikowski K., Wurmser C., Taponen J., Rautala H., Kind A., Schnieke A., Fries R., Lohi H., Andersson M. In frame exon skipping in UBE3B is associated with developmental disorders and increased mortality in cattle. BMC Genomics, 2014, vol. 15, pp. 890–898. DOI:10.1186/1471-2164-15-890
  25. Null D.J., Hutchison J.L., Bickhart D.M., VanRaden P.M., Cole J.B. Discovery of a haplotype affecting fertility in Ayrshire dairy cattle and identification of a putative causal variant. Journal of Dairy Science, 2017, vol. 100 [Suppl. 2], no. 199 [abstr. 205], p. 1. Available at: https://m.adsa.org/2017/abs/t/70060
  26. Guarini A.R., Kroezen V., Miglior F., Lourenco D.A.L., Brito L.F., Sargolzaei M. Estimating the Impact of Deleterious Recessive Haplotypes AH1 and AH2 on Reproduction in Ayrshire Cattle. Plant and Animal Genome XXVI Conference, 2018, P0482, р. 1.
  27. Cole J.B., Van Raden P.M., Null D.J., Hutchison J.L., Cooper T.A., Hubbard S.M. Haplotype tests for recessive disorders that affect fertility and other traits. AIP Research Report Genomic3 [09-13]. Updated Nov. 24, 2017. Available at: https://aipl.arsusda.gov/reference/recessive_haplotypes_ARR-G3.html. DOI: 10.1371/journal.pone.0054872
  28. Зиновьева Н., Стрекозов Н., Ескин Г., Турбина И., Янчуков И. Моногенные наследственные дефекты и их роль в воспроизводстве // Животноводство России. 2015. № 6. С. 30–31.
  29. Зиновьева Н.А. Гаплотипы фертильности голштинского скота // Сельскохозяйственная биология. 2016. Т. 51. № 4. С. 423–435. DOI: 10.15389/agrobiology.2016.4.423rus
  30. Романенкова О.С. Исследование полиморфизмов в генах APAF1, SMC2 и GART, ассоциированных с гаплотипами фертильности HH1, HH3 и HH4 голштинского и голштинизированного крупного рогатого скота: дис. ... канд. биол. наук. Дубровицы, 2016. 108 c.
  31. Van Raden P.M., Olson K.M., Null D.J., Hutchison J.L. Harmful recessive effects on fertility detected by absence of homozygous haplotypes. Journal of Dairy Science, 2011, vol. 94, no. 12, pp. 6153–6161. DOI: 10.3168/jds.2011-4624
  32. Schwarzenbacher H., Burgstaller J., Seefried F.R., Wurmser C., Hilbe M., Jung S., Fuerst C., Dinhopl N., Weissenböck H., Fuerst-Waltl B., Dolezal M., Winkler R., Grueter O., Bleul U., Wittek T., Fries R., Pausch H. A missense mutation in TUBD1 is associated with high juvenile mortality in Braunvieh and Fleckvieh cattle. BMC Genomics, 2016, vol. 25, no. 14, pp. 400–412. DOI: 10.1186/s12864-016-2742-y
  33. Sonstegard T.S., Cole J.B., Van Raden P.M., Van Tassell C.P., Null D.J., Schroeder S.G., Bickhart D., McClure M.C. Identification of a nonsense mutation in CWC15 associated with decreased reproductive efficiency in Jersey cattle. PLoS ONE, 2013, vol. 8, no. 1, pp. 1–6. DOI: 10.1371/journal.pone. 0054872.t003
  34. Van Raden P., Null D., Hutchison J., Bickhart D., Schroeder S. Jersey haplotype 2 (JH2). Changes to evaluation system (August 2014). Available at: https://www.cdcb.us/ reference/changes/eval1408.htm (accessed 12.08.2015).
  35. Pausch H., Schwarzenbacher H., Burgstaller J., Flisikowski K., Wurmser C., Jansen S., Jung S., Schnieke A., Wittek T., Fries R. Homozygous haplotype deficiency reveals deleterious mutations compromising reproductive and rearing success in cattle. BMC Genomics, 2015, vol.16, no. 312, pp. 1–13. DOI: 10.1186/s12864-015-1483-7
  36. Fritz S., Capitan A., Djari A., Rodriguez S.C., Barbat A., Baur A., Grohs C., Weiss B., Boussaha M., Esquerré D., Klopp C., Rocha D., Boichard D. Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2. PLoS One, 2013, vol. 8, no. 6, pp. 1–8. DOI: 10.1371/journal.pone.0065550
  37. Kadri N.K., Sahana G., Charlier C., Iso-Touru T., Guldbrandtsen B., Karim L., Nielsen U.S., Panitz F., Aamand G.P., Schulman N., Georges M., Vilkki J., Lund M.S., Druet T. A 660-Kb deletion with antagonistic effects on fertility and milk production segregates at high frequency in Nordic Red cattle: additional evidence for the common occurrence of balancing selection in livestock. PLoS Genetics, 2014, vol. 10, no. 1, pp. 1–11. DOI: 10.1371/journal.pgen.1004049
  38. Storlien H. Effekt av AH1 på dødfødsler og tidlig utrangering av kalv hos NRF. NMBU, 2018, 54 p. Available at: https://brage.bibsys.no/xmlui/bitstream/handle/11250/2559010/Storlien2018%20.pdf?sequence=1&isAllowed=y
  39. Chen W.-H., Lu G., Chen X., Zhao X.-M., Bork P. OGEE v2: an update of the online gene essentiality database with special focus on differentially essential genes in human cancer cell lines. Nucleic Acids Research, 2017, vol. 45, pp. D940–D944. DOI: 10.1093/nar/gkw1013
  40. Taylor J.F., Schnabel R.D., Sutovsky P. Review: Genomics of bull fertility. Animal. The Animal Consortium, 2018, pp. 1–12. DOI: 10.1017/S1751731118000599
  41. Cole J.B., Null D.J., Van Raden P.M. Phenotypic and genetic effects of recessive haplotypes on yield, longevity, and fertility. Journal of Dairy Science, 2016, vol. 99, pp. 7274–7288. DOI: 10.3168/jds.2015-10777
  42. Mesbah-Uddin Md., Guldbrandtsen B., Iso-Touru Т., Vilkki J., De Koning D.-J., Boichard D., Lund M.S., Sahana G. Genome-wide mapping of large deletions and their population-genetic properties in dairy cattle. DNA Research, 2018, vol. 25, no. 1, pp. 49–59. DOI: 10.1093/dnares/dsx037
  43. Bickhart D.M., Liu G.E. The challenges and importance of structural variation detection in livestock. Frontiers in Genetics, 2014, vol. 5, no. 37, pp. 1–14. DOI: 10.3389/fgene.2014.00037
  44. Xu L., Cole J.B., Bickhart D.M., Hou Y., Song J., Van Raden P.M., Sonstegard T.S., Van Tassell T.P., Liu G.E. Genome wide CNV analysis reveals additional variants associated with milk production traits in Holsteins. BMC Genomics, 2014, vol. 15, no. 683, pp. 1–10. DOI: 10.1186/1471-2164-15-683
  45. Charlier C., Agerholm J. S., Coppieters W., Karlskov-Mortensen P., Li W., de Jong G., Fasquelle C., Karim L., Cirera S., Cambisano N., Ahariz N., Mullaart E., Georges M., Fredholm M. A deletion in the bovine FANCI gene compromises fertility by causing fetal death and brachyspina. PLoS One, 2012, vol. 7, no. 8, pp. 1–7. DOI: 10.1371/journal.pone.0043085
  46. Schutz E., Wehrhahn C., Wanjek M., Bortfeld R., Wemheuer W.E., Beck J., Brenig B. The holstein friesian lethal haplotype 5 (HH5) results from a complete deletion of TBF1M and cholesterol deficiency (CDH) from an ERV-(LTR) insertion into the coding region of APOB. PLoS One, 2016, vol. 11, no. 4, pp. 1–15. DOI: 10.1371/journal.pone.0154602
  47. Sahana G., Iso-Touru T., Wu X., Nielsen U.S., de Koning D.J., Lund M.S., Vilkki J., Guldbrandtsen B.A. 0.5-Mbp deletion on bovine chromosome 23 is a strong candidate for stillbirth in Nordic Red cattle. Genetics Selection Evolution, 2016, vol. 48, no. 35, pp. 1–12. DOI: 10.1186/s12711-016-0215-z
  48. Cooper T.A., Wiggans G.R., Null D.J., Hutchison J.L., Cole J.B. Genomic evaluation, breed identification, and discovery of a haplotype affecting fertility for Ayrshire dairy cattle. Journal of Dairy Science, 2014, vol. 97, pp. 3878–3882. DOI: 10.3168/jds.2013-7427
  49. OMIA. Available at: http://omia.org/OMIA001934/9913
  50. Venhoranta H., Pausch H., Flisikowski K., Taponen J., Fries R., Lohi H., Andersson M. The gonadal hypoplasia of Northern Finncattle and PIRM syndrome in Ayrshire breed. Reproduction in Domestic Animals, 2014, vol. 49, p. 42.
  51. Van Raden P.M., Smith L.A. Selection and mating considering expected inbreeding of future progeny. Journal of Dairy Science, 1999. vol. 82, no. 2, pp. 2771–2778. DOI:10.3168/jds.S0022-0302(99)75534-7
  52. Guarini A.R. Combining Genotypic, Phenotypic and Pedigree Information to Analyze Functional Traits in Dairy Cattle. Theses of dissertation. Guelph, Ontario, Canada, 2017. URL: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/12165
  53. Рrimer3. Available at: http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0
  54. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве / Н.А. Зиновьева [и др.]. Дубровицы, 1998. 47 с.
  55. CDN. Managing recessives & haplotypes. GENETICS 101, 2016. Available at: https://www.holstein.ca/PublicContent/PDFS/Genetics101_SeptOct16.pdf (accessed 05.09.2018).
  56. U.S. ABA. Ayrshire Sires Identified As Haplotype Carriers (updated August. 2018). Available at: http://www.usayrshire.com/genetics.html (accessed 01.10.2018).
  57. Ковалюк Н.В., Мачульская Е.В., Сацук В.Ф., Шахназарова Ю.Ю. Новая тест-система для выявления полиморфизма аллелей гена UBE3B крупного рогатого скота айрширской породы // Сб. науч. тр. Северо-Кавказ. науч.-исслед. ин-та животноводства, Краснодар: ФГБНУ СКНИИЖ, 2017. Т. 6. № 3. С. 12–16.

Полная версия статьи